Yo reinstalé el firefox la semana pasada y justamente tuve que exportar los marcadores. Apretás CTRL+SHIFT+B y ahí importar y resguardar > resguardar y guardás el archivo en json, a mi me guardó los marcadores exactamente como los tenía antes con las carpetas y en el orden que estaba todo. Yo tengo la pc y la tablet conectadas con el Sync y sincroniza todas las contraseñas pero no los marcadores (capaz porque estoy en android)